Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 CDC15YAR019C 2925 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YJR061WYJR061W 2808 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BCK2YER167W 2556 nt4.03□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 MGA1YGR249W 1371 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PEX30YLR324W 1572 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 TRM11YOL124C 1302 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 NHP10YDL002C 612 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 DPB4YDR121W 591 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 BSC2YDR275W 708 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 FCF1YDR339C 570 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PRP18YGR006W 756 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 GSP1YLR293C 660 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RPC34YNR003C 954 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 ATG34YOL083W 1239 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PLP2YOR281C 861 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YCL022CYCL022C 516 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 MSS4YDR208W 2340 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 AZR1YGR224W 1842 nt4.02□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SPC105YGL093W 2754 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RAD1YPL022W 3303 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PRP11YDL043C 801 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YDL094CYDL094C 510 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 IZH1YDR492W 951 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 UBC8YEL012W 657 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 AHP1YLR109W 531 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 FYV6YNL133C 522 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SUI1YNL244C 327 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 DCP1YOL149W 696 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YOL162WYOL162W 648 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PBN1YCL052C 1251 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PHO84YML123C 1764 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YTM1YOR272W 1383 nt4.01□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RRN11YML043C 1524 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 TRS85YDR108W 2097 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PIB1YDR313C 861 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RPS18AYDR450W 441 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SPT15YER148W 723 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 GVP36YIL041W 981 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PET130YJL023C 1044 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 URA4YLR420W 1095 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 DUG3YNL191W 1074 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RPS19AYOL121C 435 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YPL077CYPL077C 723 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 ICS2YBR157C 768 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 FRM2YCL026C-A 582 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 FAR10YLR238W 1437 nt4□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 MET17YLR303W 1335 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 MSK1YNL073W 1731 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RAD55YDR076W 1221 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 API2YDR525W 330 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PER33YLR064W 822 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YPT53YNL093W 663 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SSU72YNL222W 621 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 IRC13YOR235W 315 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YBR242WYBR242W 717 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 EPO1YMR124W 2832 nt3.99□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 NHX1YDR456W 1902 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 HTD2YHR067W 843 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 AUR1YKL004W 1206 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 NEJ1YLR265C 1029 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YBR013CYBR013C 390 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SUR1YPL057C 1149 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 MRPL27YBR282W 441 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PEX34YCL056C 435 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 HMG1YML075C 3165 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 CTM1YHR109W 1758 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YPL109CYPL109C 1974 nt3.98□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SEC59YMR013C 1560 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 IMH1YLR309C 2736 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 ULP1YPL020C 1866 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 BRE4YDL231C 3378 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 PFS1YHR185C 714 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 BOS1YLR078C 735 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RPL15BYMR121C 615 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SSO2YMR183C 888 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 SIL1YOL031C 1266 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 RTG3YBL103C 1461 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 TRF5YNL299W 1929 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 FRT2YAL028W 1587 nt3.97□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YNR066CYNR066C 1311 nt3.96□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YPR148CYPR148C 1308 nt3.96□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 YGR117CYGR117C 1431 nt3.96□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 CIT1YNR001C 1440 nt3.96□□□□□ -1.77
NMD4Q12129 GCD1YOR260W 1737 nt3.96□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YDR355CYDR355C 303 nt3.96□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YGL188CYGL188C 174 nt3.96□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YHR173CYHR173C 339 nt3.96□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 CCL1YPR025C 1182 nt3.96□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 ULS1YOR191W 4860 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 NUP85YJR042W 2235 nt3.95□□□□□ -1.78
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