Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms