Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C19orf57Q0VDD7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C19orf57Q0VDD7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms