Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX9Q08211 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms