Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNK2Q07912 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNK2Q07912 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms