Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EGR3Q06889 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms