Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EN1Q05925 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EN1Q05925 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EN1Q05925 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EN1Q05925 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EN1Q05925 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EN1Q05925 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EN1Q05925 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EN1Q05925 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EN1Q05925 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EN1Q05925 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EN1Q05925 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EN1Q05925 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EN1Q05925 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EN1Q05925 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EN1Q05925 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EN1Q05925 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EN1Q05925 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms