Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN12Q05209 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms