Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGFBR3Q03167 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGFBR3Q03167 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms