Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL6Q02878 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL6Q02878 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms