Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLOD1Q02809 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLOD1Q02809 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms