Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC2Q02487 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms