Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A3Q01959 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms