Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms