Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN7AQ01118 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms