Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRCDQ00LT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms