Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms