Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK16Q00536 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms