Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB1P62873 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GNB1P62873 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms