Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms