Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM258P61165 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms