Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFC1P60507 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms