Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA9P57773 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA9P57773 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA9P57773 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA9P57773 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA9P57773 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms