Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3AP57075 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms