Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms