Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD23AP54725 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms