Protein–RNA interactions for Protein: P54687

BCAT1, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAT1P54687 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAT1P54687 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAT1P54687 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAT1P54687 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms