Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMTNP53814 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMTNP53814 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMTNP53814 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMTNP53814 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMTNP53814 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMTNP53814 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMTNP53814 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMTNP53814 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms