Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2A2P52657 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2A2P52657 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms