Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB27AP51159 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB27AP51159 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms