Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms