Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms