Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT5P48643 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT5P48643 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT5P48643 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT5P48643 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT5P48643 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT5P48643 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT5P48643 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms