Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RXRGP48443 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RXRGP48443 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RXRGP48443 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RXRGP48443 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms