Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTX2P47972 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms