Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RANGAP1P46060 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms