Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGIRP43119 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGIRP43119 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGIRP43119 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGIRP43119 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGIRP43119 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGIRP43119 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms