Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A1P43005 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A1P43005 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms