Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TGFBR1P36897 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms