Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPB2P35606 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPB2P35606 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPB2P35606 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPB2P35606 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPB2P35606 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPB2P35606 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPB2P35606 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPB2P35606 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms