Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN7P35236 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN7P35236 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms