Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1CAMP32004 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1CAMP32004 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms