Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA6P31267 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms