Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECHS1P30084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms