Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms