Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLNP26678 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLNP26678 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLNP26678 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLNP26678 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PLNP26678 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms