Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTX3P26022 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTX3P26022 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTX3P26022 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTX3P26022 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTX3P26022 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTX3P26022 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTX3P26022 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms