Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms