Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM1P23921 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM1P23921 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM1P23921 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM1P23921 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM1P23921 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM1P23921 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RRM1P23921 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms