Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCKDHBP21953 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCKDHBP21953 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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